浙江海洋大学船海与港航工程实验教学中心的前身是创建于 2003 年的船舶与渔具水动力实验室，2010 年整合当时的船舶与建筑工程学院下属的船舶与渔具水动力实验室、船舶设计与建造实验室、港口航道与海岸工程实验室、力学实验室，组建船舶与临港工程实验教学中心，并列入浙江省本科高校实验教学示范中心建设点。2013 年，浙江海洋大学为进一步对接海洋经济发展和舟山群岛新区建设，提高涉海类工程技术人才的培养质量，再次对涉海类学科进行院系调整和资源整合，根据强化“港口-船舶-航海”专业链建设要求，将船舶与临港工程实验教学中心、电工电子实验教学中心、工程技术实训教学中心等三个省级实验教学中心建设点及海运综合实验实训中心合并，成立船海与港航工程实验教学中心。